溫泉挑選原則應考量自然資源與實質環境，以及未來預計發展之目標，分別就資源條件、土地利用條件、基地條件以及實質環境條件等四個面項考慮，其相關說明如下：
- 資源條件：地質條件、構造特性、溫泉露頭水溫水量、地區性地下水補注量。
- 土地利用條件：環境敏感度、取供周邊使用腹地、未來土地開發的取得、溫泉法或其他相關法規的限制。
- 基地條件：溫泉孔的井場開平、溫水輸送管線的施工難易程度、聚落發展、公共設施、交通便利性、溫泉孔與腹地的距離、住宿設施。
- 實質環境條件：景觀資源、相關環境的衝擊程度、大環境的配合程度、開發程度。